Bill Markham é um engenheiro americano encarregue de construir uma barragem na selva da Amazónia. No decurso da construção é destruída uma grande quantidade de área florestal. Um dia, Markham assiste ao rapto do seu filho de sete anos, levado a cabo pelos Índios. Durante muitos anos, Markham procura o seu filho desaparecido em vão. Entretanto, Tommy fora adaptado pelos Índios - pela tribo 'Povo Invisível' - e criado como um guerreiro. Após dez anos de buscas, Markham finalmente encontra o seu filho e dois mundos diferentes colidem. Agora crescido e recentemente nomeado guerreiro, Tommy vive feliz com a tribo amante da natureza e não deseja de todo regressar à 'civilização' com o seu pai...

A Floresta Esmeralda baseia-se na verdadeira história de um miúdo de sete anos, filho de um engenheiro peruano, raptado no Brasil em 1972. Alguns anos mais tarde, o pai descobre que o seu filho se havia tornado o chefe de uma tribo da Amazónias.