Os feitos do Almirante Kirk na derrota de Klan e na criação do planeta Genesis, são vitórias pouco significativas.

Spock está morto e McCoy ficou inexplicavelmente louco.

Mais eis que a visita surpresa de Sarek, pai de Spock, aporta uma alarmante revelação: McCoy alberga a essência viva de Spock. Com um amigo vivo e outro não, mas ambos em sofrimento, Kirk tenta ajudá-los, furtando a nave espacial U.S.S. Enterprise e desafiando a quarentena da Frota Espacial do planeta Genesis. Mas os Klingons também aprenderam algo sobre Genesis e vão ao encontro de Kirk para uma batalha mortal.