Uma unidade militar de elite (SG-1) vê-se forçada a regressar à Terra quando dois membros da equipa desaparecem inexplicavelmente. Mas regressam a um mundo em que o Stargate - um antigo aparelho que permite viajar para centenas de planetas - nunca foi descoberto, e a sua própria história foi apagada. Agora, têm de convencer um governo dúbio e militarista que o tempo foi alterado por um poderoso inimigo alienígena (Ba'al) com o intuito de conquistar a Terra e o tempo não está do lado deles...