Nascidas num mundo cheio de perconceitos, existem crianças que possuem poderes extraordinários e poderosos - o resultado de mutações genéticas singulares. Cyclops liberta raios de energia dos seus olhos. Storm consegue manipular o tempo à sua vontade. Rogue absorve a força vital de qualquer pessoa que ela toque. Mas, sob a tutela do Professor Xavier (Patrick Stewart), estes e outros elementos postos de lado pela sociedade, aprendem a controlar os seus poderes e direccioná-los para o bem da humanidade. Agora, eles têm de protegem aqueles que têm medo deles do maléfico Magneto (Ian McKellen), que acredita que os humanos e os mutantes nunca poderão co-existir, e revela o seu sinistro plano para o futuro. Uma aventura cheia de fantásticos efeitos especiais de cortar a respiração e personagens inesquecíveis.